Ο φάρυγγας περιλαμβάνει ρινοφάρυγγα, στοματοφάρυγγα και λαρυγγοφάρυγγα. Οι βλεννογόνοι των τριών είναι συνεχείς και ανήκουν στην ανώτερη αναπνευστική οδό.Ρινοφαρυγγικά επιχρίσματα και στοματοφαρυγγικά επιχρίσματαέχουν μόνο διαφορετικές διαδρομές δειγματοληψίας. Η δειγματοληψία από το στόμα είναι στοματοφάρυγγαΜάκτρο, η ρινική δειγματοληψία είναι ρινοφαρυγγικήμάκτρο.Επειδή όμως το στοματοφαρυγγικόμάκτρομπορεί να χειρουργηθεί ανοίγοντας το στόμα, είναι σχετικά απλό, επομένως χρησιμοποιείται πιο συχνά κλινικά, αλλά ο κίνδυνος έκθεσης του δειγματολήπτη είναι υψηλότερος.
Το νέο τεστ νουκλεϊκού οξέος για την πνευμονία του κορωνοϊού μπορεί να λάβει για εξέταση τα ρινοφαρυγγικά επιχρίσματα, τα πτύελα και άλλες εκκρίσεις του κατώτερου αναπνευστικού, αίμα, κόπρανα και άλλα δείγματα του ασθενούς. Για το νουκλεϊκό οξύ του νέου κοροναϊού, εάν το νουκλεϊκό οξύ του δείγματος είναι θετικό, μπορεί να επιβεβαιωθεί η λοίμωξη από τον ιό. Η νέα μόλυνση από κορωνοϊό επηρεάζει κυρίως τα βρογχικά επιθηλιακά κύτταρα και τα κυψελιδικά επιθηλιακά κύτταρα. Δείγματα κατώτερης αναπνευστικής οδού, όπως εκχυλίσματα πτυέλων και αεραγωγών, θα πρέπει να χρησιμοποιούνται όσο το δυνατόν περισσότερο για να αντικατοπτρίζουν με μεγαλύτερη ακρίβεια τη μόλυνση από τον ιό.